ცეოლითის მოლეკულურ საცერებს აქვთ ძლიერი გამიჯვნა აზოტზე და ჟანგბადზე.მას აქვს ბროლის სტრუქტურა და მახასიათებლები, ზედაპირი არის მყარი ჩონჩხი და შიდა ღრუებს შეუძლიათ შეასრულონ ადსორბციული მოლეკულების როლი.ღრუებს შორის არის ერთმანეთთან დაკავშირებული ფორები და მოლეკულები გადიან ფორებს.ფორების სუფთა ბუნების გამო, მოლეკულური საცრის ფორების ზომის განაწილება ძალიან ერთგვაროვანია.მოლეკულური საცრები შერჩევით ადსორბირებენ მოლეკულებს მათი კრისტალების შიგნით არსებული ფორების ზომის მიხედვით, ანუ ადსორბირებენ გარკვეული ზომის მოლეკულებს უფრო დიდი ნივთიერებების მოლეკულების მოგერიებისას.